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해양공학 세부전공에서는 빅데이터 기반의 연안공학, 수중 무선통신과 위성 활용 기술, 연안환경 정화기술 개발 등 해양 공간과 자원의 활용을 증대시키기 위한 교육을 통하여 해양강국을 이끌어갈 인재를 양성하는 것을 목표로 하고 있습니다.

해양생명공학 세부전공에서는 다양한 해양생물의 채집과 배양을 기반으로 하여 이들의 유전체, 단백체, 대사체 등의 오믹스 연구를 수행하고 그 결과물로부터 신약, 신기능 소재 등을 개발하기 위한 다양한 지식과 장비 운영, 분석기술 습득을 통하여 해양생명공학기술 개발에 이바지할 전문인력 양성을 목표로 합니다.

런던의정서 경영공학 세부전공은 런던의정서 준수 지원을 위해 해양환경 및 연안공학 분야 사업에 관여하는 외국 공무원을 대상으로 개설된 전문석사학위 과정이다. 이 전공은 런던의정서의 주요 의제인 폐기물 해양투기 및 해양환경복원에 관한 문제들과 연안공학에 대한 지식 및 기술 습득을 통해 해양/연안 관련 프로젝트를 효과적으로 관리하는 전문인력 양성을 목표로 하고 있다.